36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3478 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 160 aa  316  1e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0680  Polyketide cyclase/dehydrase  35.86 
 
 		 152 aa  91.3  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  36 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  36 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  36 
 
 		 150 aa  90.1  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.33 
 
 		 150 aa  83.6  0.000000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1713  cyclase/dehydrase  33.56 
 
 		 150 aa  80.1  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922444  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3703  Polyketide cyclase/dehydrase  31.33 
 
 		 153 aa  73.6  0.000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2072  hypothetical protein  32.68 
 
 		 154 aa  68.6  0.00000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847014  normal  0.0441892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2280  Polyketide cyclase/dehydrase  28.93 
 
 		 160 aa  67.4  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109038  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4642  hypothetical protein  36.56 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0318  hypothetical protein  30.92 
 
 		 168 aa  54.7  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05100  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  32 
 
 		 246 aa  52  0.000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2018  hypothetical protein  33.75 
 
 		 151 aa  51.6  0.000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.45378  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4102  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.34 
 
 		 165 aa  50.4  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3553  hypothetical protein  32.21 
 
 		 147 aa  49.3  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4552  cyclase/dehydrase  31.54 
 
 		 432 aa  48.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1087  hypothetical protein  34.34 
 
 		 162 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27543  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1098  hypothetical protein  34.34 
 
 		 154 aa  47.8  0.00007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3261  hypothetical protein  32.29 
 
 		 165 aa  47.4  0.00008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1071  hypothetical protein  37.5 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2201  hypothetical protein  32.5 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000302172 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4328  hypothetical protein  34 
 
 		 171 aa  46.2  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5173  hypothetical protein  32.24 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3627  Polyketide cyclase/dehydrase  48.72 
 
 		 171 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00050746 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5085  hypothetical protein  32.24 
 
 		 155 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.208628  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.58 
 
 		 161 aa  42.4  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5463  hypothetical protein  32.61 
 
 		 155 aa  42  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2976  Polyketide cyclase/dehydrase  31.76 
 
 		 141 aa  41.6  0.004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12791  hypothetical protein  29.03 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0103  cyclase/dehydrase  29.37 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.556284  normal  0.137668 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0122  cyclase/dehydrase  29.37 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.367353  normal  0.0154258 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0113  hypothetical protein  29.37 
 
 		 148 aa  40.8  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0604  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.86 
 
 		 155 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11911  hypothetical protein  30.38 
 
 		 158 aa  40.4  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0060  cyclase/dehydrase  32.63 
 
 		 185 aa  40.4  0.01  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>