32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2280 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2280  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 
160 aa  329  8e-90  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109038  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0680  Polyketide cyclase/dehydrase  39.87 
 
 
152 aa  115  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.57 
 
 
150 aa  102  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1713  cyclase/dehydrase  35.14 
 
 
150 aa  98.6  3e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922444  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  37.93 
 
 
150 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  37.93 
 
 
150 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  37.93 
 
 
150 aa  98.6  4e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3703  Polyketide cyclase/dehydrase  36.91 
 
 
153 aa  87.8  6e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4642  hypothetical protein  30.26 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4102  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.3 
 
 
165 aa  68.2  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  28.93 
 
 
160 aa  67.4  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1098  hypothetical protein  32 
 
 
154 aa  65.5  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1087  hypothetical protein  32 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27543  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1071  hypothetical protein  33.33 
 
 
145 aa  64.7  0.0000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2072  hypothetical protein  29.33 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847014  normal  0.0441892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3553  hypothetical protein  35.87 
 
 
147 aa  57.4  0.00000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05100  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  35.96 
 
 
246 aa  56.6  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.25 
 
 
747 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4328  hypothetical protein  34.29 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.9 
 
 
161 aa  47.8  0.00007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12791  hypothetical protein  35.53 
 
 
156 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5463  hypothetical protein  26.85 
 
 
155 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2783  cyclase/dehydrase  28.03 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2769  cyclase/dehydrase  30.39 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5173  hypothetical protein  26.85 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5085  hypothetical protein  26.85 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.208628  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2739  cyclase/dehydrase  27.92 
 
 
147 aa  44.3  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1770  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.69 
 
 
148 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3261  hypothetical protein  29.53 
 
 
165 aa  43.1  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.51311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8957  hypothetical protein  27.45 
 
 
156 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11911  hypothetical protein  27.67 
 
 
158 aa  41.6  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4005  cyclase/dehydrase  25.66 
 
 
164 aa  41.2  0.006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>