32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0680 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0680  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 
152 aa  305  1.0000000000000001e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3703  Polyketide cyclase/dehydrase  50.66 
 
 
153 aa  160  6e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1713  cyclase/dehydrase  50.99 
 
 
150 aa  155  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922444  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  48.03 
 
 
150 aa  149  1e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  50.66 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  50.66 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  50.66 
 
 
150 aa  145  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2280  Polyketide cyclase/dehydrase  39.87 
 
 
160 aa  115  1.9999999999999998e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  35.86 
 
 
160 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4102  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.52 
 
 
165 aa  68.9  0.00000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4642  hypothetical protein  31.07 
 
 
149 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2072  hypothetical protein  28.85 
 
 
154 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847014  normal  0.0441892 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3553  hypothetical protein  31.54 
 
 
147 aa  58.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05100  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  27.7 
 
 
246 aa  56.2  0.0000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11911  hypothetical protein  29.61 
 
 
158 aa  51.6  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2783  cyclase/dehydrase  30.77 
 
 
153 aa  47  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1464  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.86 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.08 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2769  cyclase/dehydrase  30.77 
 
 
153 aa  45.4  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4552  cyclase/dehydrase  27.52 
 
 
432 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2739  cyclase/dehydrase  30.1 
 
 
147 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1098  hypothetical protein  27.39 
 
 
154 aa  44.7  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5463  hypothetical protein  28.97 
 
 
155 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5085  hypothetical protein  29 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.208628  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5173  hypothetical protein  29 
 
 
155 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0318  hypothetical protein  28.43 
 
 
168 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1087  hypothetical protein  26.28 
 
 
162 aa  43.5  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27543  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4200  MxaD protein, putative  33.33 
 
 
184 aa  42.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.240812  normal  0.311145 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8030  MxaD protein, putative  35.71 
 
 
177 aa  42.4  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.816578  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8957  hypothetical protein  25.49 
 
 
156 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2291  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  27.93 
 
 
155 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.508065  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0135  hypothetical protein  29.35 
 
 
135 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0688189 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>