32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3553 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_3553  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  301  3.0000000000000004e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2072  hypothetical protein  37.24 
 
 
154 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847014  normal  0.0441892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8957  hypothetical protein  31.79 
 
 
156 aa  72.8  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4642  hypothetical protein  35.37 
 
 
149 aa  70.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5085  hypothetical protein  34.46 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.208628  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5463  hypothetical protein  34.46 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5173  hypothetical protein  34.46 
 
 
155 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  31.25 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  31.25 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.86 
 
 
150 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.18 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1713  cyclase/dehydrase  28.67 
 
 
150 aa  65.5  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922444  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1087  hypothetical protein  33.56 
 
 
162 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27543  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0318  hypothetical protein  38.78 
 
 
168 aa  64.3  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05100  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  29.25 
 
 
246 aa  63.5  0.0000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1071  hypothetical protein  33.79 
 
 
145 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1098  hypothetical protein  33.56 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.77 
 
 
747 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3703  Polyketide cyclase/dehydrase  28.08 
 
 
153 aa  60.5  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2783  cyclase/dehydrase  37.14 
 
 
153 aa  58.5  0.00000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0680  Polyketide cyclase/dehydrase  31.54 
 
 
152 aa  58.2  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2739  cyclase/dehydrase  38.61 
 
 
147 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2280  Polyketide cyclase/dehydrase  35.87 
 
 
160 aa  57.4  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109038  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2769  cyclase/dehydrase  37.14 
 
 
153 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12791  hypothetical protein  32.43 
 
 
156 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4328  hypothetical protein  34.91 
 
 
171 aa  54.7  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4102  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.58 
 
 
165 aa  53.5  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11911  hypothetical protein  31.79 
 
 
158 aa  50.4  0.000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  32.21 
 
 
160 aa  49.3  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4552  cyclase/dehydrase  29.73 
 
 
432 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5222  Polyketide cyclase/dehydrase  29.53 
 
 
147 aa  40  0.01  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178812  normal  0.128048 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>