14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3703 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3703  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 
153 aa  309  6.999999999999999e-84  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0680  Polyketide cyclase/dehydrase  50.66 
 
 
152 aa  160  6e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  42.76 
 
 
150 aa  133  8e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1713  cyclase/dehydrase  42.38 
 
 
150 aa  130  5e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922444  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  42.76 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  42.76 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  42.76 
 
 
150 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2280  Polyketide cyclase/dehydrase  36.91 
 
 
160 aa  87.8  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109038  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  31.33 
 
 
160 aa  73.6  0.0000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4102  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.94 
 
 
165 aa  66.2  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3553  hypothetical protein  28.08 
 
 
147 aa  60.5  0.000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8957  hypothetical protein  25.48 
 
 
156 aa  46.6  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2072  hypothetical protein  29.17 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847014  normal  0.0441892 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4642  hypothetical protein  23.3 
 
 
149 aa  42  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>