30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0318 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0318  hypothetical protein  100 
 
 
168 aa  340  7e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2783  cyclase/dehydrase  39.13 
 
 
153 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2072  hypothetical protein  37.18 
 
 
154 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847014  normal  0.0441892 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4552  cyclase/dehydrase  36.22 
 
 
432 aa  65.5  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2769  cyclase/dehydrase  39.13 
 
 
153 aa  65.1  0.0000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2739  cyclase/dehydrase  40.18 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3553  hypothetical protein  38.78 
 
 
147 aa  64.3  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4642  hypothetical protein  34.62 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0871  Polyketide cyclase/dehydrase  31.13 
 
 
165 aa  61.6  0.000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11911  hypothetical protein  40 
 
 
158 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8957  hypothetical protein  35.44 
 
 
156 aa  57  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1713  cyclase/dehydrase  31.47 
 
 
150 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922444  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.81 
 
 
150 aa  55.5  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  34.02 
 
 
150 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  34.02 
 
 
150 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  34.02 
 
 
150 aa  55.5  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  30.92 
 
 
160 aa  54.7  0.0000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05100  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  27.97 
 
 
246 aa  48.9  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4005  cyclase/dehydrase  28.66 
 
 
164 aa  48.5  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5173  hypothetical protein  29.25 
 
 
155 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5085  hypothetical protein  29.25 
 
 
155 aa  47.4  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.208628  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12791  hypothetical protein  31.31 
 
 
156 aa  47  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1098  hypothetical protein  29.19 
 
 
154 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1087  hypothetical protein  29.19 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27543  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5463  hypothetical protein  28.3 
 
 
155 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.04 
 
 
161 aa  45.4  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1071  hypothetical protein  28.76 
 
 
145 aa  45.1  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0680  Polyketide cyclase/dehydrase  28.43 
 
 
152 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4102  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.68 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.26 
 
 
747 aa  40.4  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>