17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_4005 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_4005  cyclase/dehydrase  100 
 
 		 164 aa  325  2.0000000000000001e-88  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0871  Polyketide cyclase/dehydrase  47.77 
 
 		 165 aa  144  6e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11911  hypothetical protein  34.86 
 
 		 158 aa  58.9  0.00000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4552  cyclase/dehydrase  30.28 
 
 		 432 aa  58.5  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2783  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2769  cyclase/dehydrase  33.33 
 
 		 153 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2739  cyclase/dehydrase  35.09 
 
 		 147 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05100  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  30.39 
 
 		 246 aa  50.8  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2072  hypothetical protein  30.41 
 
 		 154 aa  50.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847014  normal  0.0441892 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0318  hypothetical protein  28.66 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06190  hypothetical protein  32.04 
 
 		 157 aa  47.8  0.00007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.19 
 
 		 747 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8957  hypothetical protein  29.36 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.23 
 
 		 161 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1087  hypothetical protein  32.06 
 
 		 162 aa  42.7  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27543  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4642  hypothetical protein  27.89 
 
 		 149 aa  41.6  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2280  Polyketide cyclase/dehydrase  25.66 
 
 		 160 aa  41.2  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.109038  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>