38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_06190 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_06190  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  317  3.9999999999999996e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2275  Polyketide cyclase/dehydrase  66.9 
 
 
151 aa  195  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1770  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  62.84 
 
 
148 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2607  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  63.01 
 
 
161 aa  181  5.0000000000000004e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3939  Polyketide cyclase/dehydrase  58.11 
 
 
149 aa  160  5.0000000000000005e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22480  hypothetical protein  58.94 
 
 
212 aa  158  3e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0283  hypothetical protein  52.78 
 
 
170 aa  143  1e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3232  hypothetical protein  34.97 
 
 
154 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.200936 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23960  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  33.11 
 
 
154 aa  84  8e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.151523  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01460  hypothetical protein  34.51 
 
 
160 aa  83.6  0.000000000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2557  hypothetical protein  33.1 
 
 
177 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29980  hypothetical protein  30.41 
 
 
161 aa  68.6  0.00000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633203  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0670  hypothetical protein  36.6 
 
 
154 aa  65.1  0.0000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338735  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0146  hypothetical protein  31.48 
 
 
167 aa  64.3  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5222  Polyketide cyclase/dehydrase  36.21 
 
 
147 aa  63.9  0.0000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178812  normal  0.128048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2610  hypothetical protein  32.81 
 
 
159 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0325  hypothetical protein  31.13 
 
 
147 aa  62.4  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246806  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0758  hypothetical protein  32.03 
 
 
169 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2215  hypothetical protein  32.79 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.581092  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2272  hypothetical protein  32.79 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2226  hypothetical protein  32.79 
 
 
158 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3512  hypothetical protein  31.97 
 
 
200 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3906  hypothetical protein  33.06 
 
 
159 aa  53.9  0.0000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21390  hypothetical protein  30.83 
 
 
184 aa  52.4  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10089  hypothetical protein  29.41 
 
 
224 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29102  normal  0.214951 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2697  hypothetical protein  30.26 
 
 
168 aa  51.6  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5552  hypothetical protein  30.97 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5260  hypothetical protein  30.97 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5171  hypothetical protein  30.97 
 
 
160 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2498  hypothetical protein  30.58 
 
 
159 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0838  hypothetical protein  31.72 
 
 
162 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103566  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00890  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  34.53 
 
 
194 aa  48.5  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.82 
 
 
747 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1562  hypothetical protein  32.77 
 
 
164 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4005  cyclase/dehydrase  32.04 
 
 
164 aa  47.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1616  hypothetical protein  29.8 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1592  hypothetical protein  29.8 
 
 
164 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1820  Polyketide cyclase/dehydrase  30.38 
 
 
153 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>