32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_0670 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013124  Afer_0670  hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  305  2.0000000000000002e-82  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338735  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0325  hypothetical protein  44.22 
 
 
147 aa  128  3e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246806  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5222  Polyketide cyclase/dehydrase  45.39 
 
 
147 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178812  normal  0.128048 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0838  hypothetical protein  42.76 
 
 
162 aa  101  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2610  hypothetical protein  36.5 
 
 
159 aa  95.5  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21390  hypothetical protein  41.18 
 
 
184 aa  95.1  3e-19  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10089  hypothetical protein  37.14 
 
 
224 aa  90.1  9e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29102  normal  0.214951 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5171  hypothetical protein  35.62 
 
 
160 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5260  hypothetical protein  35.62 
 
 
160 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5552  hypothetical protein  35.62 
 
 
160 aa  83.6  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0758  hypothetical protein  34.21 
 
 
169 aa  70.5  0.000000000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0146  hypothetical protein  37.18 
 
 
167 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2275  Polyketide cyclase/dehydrase  36.73 
 
 
151 aa  70.5  0.000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3939  Polyketide cyclase/dehydrase  39.02 
 
 
149 aa  69.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1592  hypothetical protein  34.62 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1616  hypothetical protein  34.62 
 
 
164 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1562  hypothetical protein  34.62 
 
 
164 aa  65.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06190  hypothetical protein  36.6 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2607  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.88 
 
 
161 aa  65.1  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3232  hypothetical protein  32.43 
 
 
154 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.200936 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1770  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.89 
 
 
148 aa  61.2  0.000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2697  hypothetical protein  31.65 
 
 
168 aa  61.6  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0283  hypothetical protein  32 
 
 
170 aa  55.1  0.0000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22480  hypothetical protein  30.41 
 
 
212 aa  55.5  0.0000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2557  hypothetical protein  30.99 
 
 
177 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00890  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  35.19 
 
 
194 aa  53.5  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23960  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  29.45 
 
 
154 aa  52.8  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.151523  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01460  hypothetical protein  31.21 
 
 
160 aa  52.8  0.000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1820  Polyketide cyclase/dehydrase  28.86 
 
 
153 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29980  hypothetical protein  31.58 
 
 
161 aa  51.6  0.000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633203  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2498  hypothetical protein  29.93 
 
 
159 aa  47  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3906  hypothetical protein  27.56 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>