40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_3939 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_3939  Polyketide cyclase/dehydrase  100 
 
 
149 aa  299  9e-81  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2275  Polyketide cyclase/dehydrase  63.51 
 
 
151 aa  187  5.999999999999999e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2607  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  65.77 
 
 
161 aa  187  5.999999999999999e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0283  hypothetical protein  63.89 
 
 
170 aa  186  7e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1770  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  62.42 
 
 
148 aa  177  2.9999999999999997e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.268831  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22480  hypothetical protein  61.9 
 
 
212 aa  172  9e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06190  hypothetical protein  58.11 
 
 
157 aa  160  4.0000000000000004e-39  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3232  hypothetical protein  36.81 
 
 
154 aa  97.8  4e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.200936 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23960  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  35.76 
 
 
154 aa  87.4  6e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.151523  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01460  hypothetical protein  34.97 
 
 
160 aa  84  6e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2557  hypothetical protein  35.51 
 
 
177 aa  84  7e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.205092  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29980  hypothetical protein  35.62 
 
 
161 aa  82.4  0.000000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.633203  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0670  hypothetical protein  39.02 
 
 
154 aa  69.7  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.338735  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5222  Polyketide cyclase/dehydrase  36.11 
 
 
147 aa  65.9  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.178812  normal  0.128048 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0325  hypothetical protein  32 
 
 
147 aa  65.1  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.246806  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2610  hypothetical protein  33.06 
 
 
159 aa  64.7  0.0000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2215  hypothetical protein  31.97 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.581092  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2272  hypothetical protein  31.97 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.509187  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2226  hypothetical protein  31.97 
 
 
158 aa  64.3  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.424753  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00890  Activator of Hsp90 ATPase homolog 1-like protein  34.68 
 
 
194 aa  62.4  0.000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1820  Polyketide cyclase/dehydrase  36.52 
 
 
153 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0146  hypothetical protein  32.26 
 
 
167 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1562  hypothetical protein  35.25 
 
 
164 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2498  hypothetical protein  28.69 
 
 
159 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.515948 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0758  hypothetical protein  34.78 
 
 
169 aa  57  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25545  normal  0.713637 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0838  hypothetical protein  35.65 
 
 
162 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.103566  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1592  hypothetical protein  34.43 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.635344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1616  hypothetical protein  34.43 
 
 
164 aa  54.3  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.790109 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3906  hypothetical protein  27.87 
 
 
159 aa  54.3  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.869283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2697  hypothetical protein  31.37 
 
 
168 aa  53.9  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.408575  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21390  hypothetical protein  31.47 
 
 
184 aa  52  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5552  hypothetical protein  31.86 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5260  hypothetical protein  31.86 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5171  hypothetical protein  31.86 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1594  N-6 Adenine-specific DNA methylase  31.13 
 
 
206 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00151639  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10089  hypothetical protein  30.25 
 
 
224 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.29102  normal  0.214951 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25210  polyketide cyclase / dehydrase family protein  34.68 
 
 
322 aa  44.7  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10614  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3512  hypothetical protein  26.9 
 
 
200 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3391  hypothetical protein  31.21 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  35.54 
 
 
160 aa  40.4  0.009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>