9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_25210 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_25210  polyketide cyclase / dehydrase family protein  100 
 
 		 322 aa  619  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.10614  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0765  Clp domain protein  30.84 
 
 		 329 aa  95.5  1e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0165  Clp domain protein  31.21 
 
 		 312 aa  82  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2787  Clp domain protein  34.04 
 
 		 332 aa  62.8  0.000000007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.193745 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6786  hypothetical protein  23.85 
 
 		 182 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0558411 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3939  Polyketide cyclase/dehydrase  34.68 
 
 		 149 aa  44.7  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0726  ATPase  25.71 
 
 		 820 aa  43.5  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0750  ATPase  25.71 
 
 		 820 aa  43.5  0.005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0092536  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  26.57 
 
 		 822 aa  43.1  0.006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>