38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4552 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_4552  cyclase/dehydrase  100 
 
 
432 aa  853    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.58 
 
 
747 aa  132  9e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  31.09 
 
 
213 aa  94.7  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11911  hypothetical protein  36.67 
 
 
158 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2769  cyclase/dehydrase  31.08 
 
 
153 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.590716  normal  0.736461 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2783  cyclase/dehydrase  31.08 
 
 
153 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8957  hypothetical protein  35.46 
 
 
156 aa  73.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.153152  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4642  hypothetical protein  38.68 
 
 
149 aa  71.2  0.00000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2739  cyclase/dehydrase  31.69 
 
 
147 aa  70.9  0.00000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.144068  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4553  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.94 
 
 
161 aa  66.6  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0318  hypothetical protein  36.22 
 
 
168 aa  65.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5173  hypothetical protein  33.77 
 
 
155 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5085  hypothetical protein  33.77 
 
 
155 aa  63.2  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.208628  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2072  hypothetical protein  33.04 
 
 
154 aa  63.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.847014  normal  0.0441892 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1243  hypothetical protein  28.88 
 
 
262 aa  63.2  0.000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407567  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5463  hypothetical protein  35.4 
 
 
155 aa  61.6  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05100  pterin-4a-carbinolamine dehydratase  33.33 
 
 
246 aa  60.1  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0785  hypothetical protein  27.46 
 
 
243 aa  59.7  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4005  cyclase/dehydrase  30.28 
 
 
164 aa  58.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5038  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  33.96 
 
 
150 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.119681 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1713  cyclase/dehydrase  34.55 
 
 
150 aa  57.8  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.922444  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1087  hypothetical protein  28.1 
 
 
162 aa  56.2  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.27543  normal  0.0589326 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1098  hypothetical protein  28.1 
 
 
154 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4102  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.7 
 
 
165 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1071  hypothetical protein  29.5 
 
 
145 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4557  cyclase/dehydrase  32.73 
 
 
150 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.455021  normal  0.091151 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4470  hypothetical protein  32.73 
 
 
150 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4853  cyclase/dehydrase  32.73 
 
 
150 aa  53.1  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.592845  normal  0.0606758 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3553  hypothetical protein  29.73 
 
 
147 aa  48.5  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3478  cyclase/dehydrase  31.72 
 
 
160 aa  48.5  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5843  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.74 
 
 
213 aa  47.4  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.737154  normal  0.680441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4328  hypothetical protein  35.24 
 
 
171 aa  47  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0680  Polyketide cyclase/dehydrase  27.52 
 
 
152 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.982143  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0871  Polyketide cyclase/dehydrase  29.17 
 
 
165 aa  46.2  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.715701  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5446  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25 
 
 
215 aa  45.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12791  hypothetical protein  28.17 
 
 
156 aa  44.7  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.630322 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2847  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.51 
 
 
152 aa  43.5  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000365676  normal  0.0147483 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  30.89 
 
 
531 aa  43.1  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>