22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5843 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5843  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 
213 aa  429  1e-119  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.737154  normal  0.680441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2034  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  39.51 
 
 
216 aa  128  6e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.568645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3557  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.18 
 
 
219 aa  127  8.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1243  hypothetical protein  30.94 
 
 
262 aa  103  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407567  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0785  hypothetical protein  37.31 
 
 
243 aa  98.6  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.27 
 
 
218 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.16 
 
 
747 aa  68.6  0.00000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  29.21 
 
 
212 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.44 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1115  hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.88 
 
 
241 aa  63.5  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  30.67 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5446  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.65 
 
 
215 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5355  hypothetical protein  29.85 
 
 
145 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4061  hypothetical protein  26.61 
 
 
232 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0644782  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1048  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.4 
 
 
241 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  30.14 
 
 
193 aa  45.1  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0955  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.1 
 
 
236 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1748  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.51 
 
 
185 aa  44.3  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2125  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.53 
 
 
284 aa  42.7  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0724883  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0672  hypothetical protein  26.92 
 
 
151 aa  42.4  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.106928  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  27.86 
 
 
531 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  36 
 
 
207 aa  42.4  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>