46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2125 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2125  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
284 aa  566  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0724883  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.78 
 
 
274 aa  168  1e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  31.4 
 
 
311 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5355  hypothetical protein  45.04 
 
 
145 aa  104  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.87 
 
 
306 aa  94  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1156  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.28 
 
 
157 aa  79.3  0.00000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.902168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1237  hypothetical protein  28.67 
 
 
157 aa  73.9  0.000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3347  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 
164 aa  73.9  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.329659  hitchhiker  0.00378546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0252  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.93 
 
 
160 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1375  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.28 
 
 
168 aa  61.6  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3262  hypothetical protein  28.47 
 
 
155 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  35.92 
 
 
177 aa  57  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  31.11 
 
 
163 aa  53.1  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000649339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  30.14 
 
 
531 aa  52.4  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1007  hypothetical protein  29.46 
 
 
140 aa  52  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2875 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2511  hypothetical protein  30.56 
 
 
134 aa  51.6  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00847737  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1416  hypothetical protein  30.09 
 
 
149 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  0.064122 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3972  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  50.1  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.604025  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  35.96 
 
 
151 aa  49.7  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1505  hypothetical protein  37.5 
 
 
166 aa  49.3  0.00008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4766  hypothetical protein  31.48 
 
 
150 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203772  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4680  hypothetical protein  31.48 
 
 
150 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.89 
 
 
222 aa  48.9  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3783  hypothetical protein  29.09 
 
 
150 aa  48.9  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.46 
 
 
747 aa  48.5  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  31.87 
 
 
213 aa  48.5  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5065  hypothetical protein  31.48 
 
 
150 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11000  conserved hypothetical protein TIGR00026  32.08 
 
 
138 aa  47  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7866  hypothetical protein  30.48 
 
 
145 aa  46.6  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0749  hypothetical protein  32.95 
 
 
167 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441888  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0743  hypothetical protein  32.95 
 
 
167 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163997  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0763  hypothetical protein  32.95 
 
 
167 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0254  hypothetical protein  26.72 
 
 
157 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  30.67 
 
 
157 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5261  hypothetical protein  31.03 
 
 
168 aa  44.3  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  28.57 
 
 
142 aa  43.9  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0512  hypothetical protein  31.18 
 
 
157 aa  43.1  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  28.77 
 
 
557 aa  43.1  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5843  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.53 
 
 
213 aa  42.7  0.007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.737154  normal  0.680441 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  28.14 
 
 
507 aa  42.4  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  27.68 
 
 
142 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  30.48 
 
 
159 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4211  hypothetical protein  29.2 
 
 
135 aa  42.4  0.009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1126  hypothetical protein  32.5 
 
 
147 aa  42.4  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.726493  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  30.48 
 
 
159 aa  42.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0484096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>