29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5355 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5355  hypothetical protein  100 
 
 		 145 aa  287  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1156  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  52.14 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.902168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2125  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  45.04 
 
 		 284 aa  104  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0724883  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  47.24 
 
 		 274 aa  103  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  40.76 
 
 		 311 aa  101  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40 
 
 		 306 aa  86.3  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1237  hypothetical protein  35.37 
 
 		 157 aa  83.6  9e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3347  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.36 
 
 		 164 aa  83.2  0.000000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.329659  hitchhiker  0.00378546 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1375  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.21 
 
 		 168 aa  79.7  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0252  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 		 160 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3262  hypothetical protein  32.35 
 
 		 155 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  32.68 
 
 		 543 aa  63.5  0.0000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  32.65 
 
 		 557 aa  63.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  30.52 
 
 		 531 aa  61.6  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5843  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.85 
 
 		 213 aa  60.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.737154  normal  0.680441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.41 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  33.33 
 
 		 507 aa  49.7  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0955  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.38 
 
 		 236 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.83 
 
 		 747 aa  47  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1243  hypothetical protein  29.29 
 
 		 262 aa  46.6  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  30.77 
 
 		 212 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  30.28 
 
 		 519 aa  44.7  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  35.29 
 
 		 437 aa  43.9  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  29.9 
 
 		 213 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1868  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.41 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5446  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.87 
 
 		 215 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1686  hypothetical protein  31.78 
 
 		 231 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.95 
 
 		 222 aa  40.8  0.006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3557  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.08 
 
 		 219 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>