30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7884 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  418  1e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.67 
 
 		 218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.93 
 
 		 222 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4061  hypothetical protein  38.05 
 
 		 232 aa  122  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0644782  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0955  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.56 
 
 		 236 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1115  hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.07 
 
 		 241 aa  101  1e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1243  hypothetical protein  30.52 
 
 		 262 aa  79.7  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407567  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0785  hypothetical protein  31.8 
 
 		 243 aa  78.6  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1048  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.67 
 
 		 241 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.14 
 
 		 747 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5843  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.21 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.737154  normal  0.680441 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  29.3 
 
 		 213 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  33.33 
 
 		 437 aa  58.2  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2034  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  29.7 
 
 		 216 aa  55.1  0.0000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.568645 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.61 
 
 		 194 aa  52.8  0.000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3557  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.5 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3814  hypothetical protein  28.98 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  27.5 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.67 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5446  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.09 
 
 		 215 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  28.33 
 
 		 193 aa  48.5  0.00007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.28 
 
 		 199 aa  48.5  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.94 
 
 		 274 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5355  hypothetical protein  30.77 
 
 		 145 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  28.44 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.09 
 
 		 191 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2540  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.86 
 
 		 155 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  27.59 
 
 		 176 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  27.5 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  24.05 
 
 		 222 aa  42.7  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>