52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_0293 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  100 
 
 		 207 aa  423  1e-118  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  74.48 
 
 		 193 aa  298  4e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  66.15 
 
 		 198 aa  261  6e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  68.57 
 
 		 176 aa  249  2e-65  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  56.77 
 
 		 191 aa  219  1.9999999999999999e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  54.64 
 
 		 194 aa  201  5e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  48.44 
 
 		 195 aa  172  3.9999999999999995e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  47.45 
 
 		 222 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  42.71 
 
 		 191 aa  137  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  42.55 
 
 		 189 aa  132  3e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.59 
 
 		 191 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.96 
 
 		 190 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.16 
 
 		 194 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  38.62 
 
 		 437 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  34.55 
 
 		 196 aa  109  3e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.81 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  32.45 
 
 		 194 aa  102  4e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  37.3 
 
 		 193 aa  88.2  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  29.56 
 
 		 196 aa  80.1  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  34.88 
 
 		 343 aa  74.3  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  30.72 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  28.93 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.67 
 
 		 196 aa  73.6  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.65 
 
 		 186 aa  71.6  0.000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  28.92 
 
 		 177 aa  62.4  0.000000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  26.83 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  28.85 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  28 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  27.5 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.45 
 
 		 183 aa  48.1  0.00009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.77 
 
 		 182 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.92 
 
 		 185 aa  47.4  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  31.48 
 
 		 180 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.92 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 178 aa  47.4  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  24.84 
 
 		 183 aa  46.6  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  26.92 
 
 		 185 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  27.27 
 
 		 188 aa  45.8  0.0005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  22.84 
 
 		 176 aa  45.4  0.0006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  25.95 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.82 
 
 		 179 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25 
 
 		 182 aa  43.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5843  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36 
 
 		 213 aa  42.4  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.737154  normal  0.680441 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  25.39 
 
 		 188 aa  42.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.64 
 
 		 178 aa  42  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7174  hypothetical protein  60.61 
 
 		 307 aa  41.6  0.008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.64 
 
 		 178 aa  41.6  0.008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.12 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0755  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.47 
 
 		 398 aa  41.6  0.009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>