48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_6235 on replicon NC_010557
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 194 aa  390  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  60.32 
 
 		 190 aa  236  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  56.28 
 
 		 191 aa  206  2e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 195 aa  135  3.0000000000000003e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.78 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.8 
 
 		 191 aa  128  6e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.07 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  37.16 
 
 		 207 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  35.08 
 
 		 222 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.95 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  37.7 
 
 		 198 aa  113  1.0000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  37.16 
 
 		 189 aa  112  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  34.78 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  33.15 
 
 		 196 aa  101  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  39.73 
 
 		 176 aa  100  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  33.88 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  38.15 
 
 		 343 aa  94  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  30.22 
 
 		 437 aa  79.7  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  28.77 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  32 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.08 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  29.53 
 
 		 193 aa  65.9  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  26.9 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.49 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7174  hypothetical protein  36.11 
 
 		 307 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  26.67 
 
 		 178 aa  51.2  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.23 
 
 		 177 aa  50.1  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  33.67 
 
 		 212 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  23.93 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2331  hypothetical protein  35 
 
 		 353 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1437  hypothetical protein  35 
 
 		 353 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3098  hypothetical protein  35 
 
 		 353 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1349  hypothetical protein  35 
 
 		 353 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1064  hypothetical protein  35 
 
 		 353 aa  46.6  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.67 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  28.07 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  24.05 
 
 		 213 aa  43.1  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.67 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.67 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1748  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.07 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.78 
 
 		 179 aa  42.7  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.31 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.16 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.16 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  23.23 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.16 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.16 
 
 		 178 aa  42.4  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.7 
 
 		 182 aa  41.2  0.01  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>