50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ping_1284 on replicon NC_008709
Organism: Psychromonas ingrahamii 37



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 179 aa  362  2e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  38.55 
 
 		 213 aa  134  7.000000000000001e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  39.11 
 
 		 183 aa  132  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  38.55 
 
 		 183 aa  131  5e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.05 
 
 		 178 aa  119  3e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.47 
 
 		 178 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.47 
 
 		 178 aa  117  7e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.47 
 
 		 178 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  35.59 
 
 		 176 aa  116  1.9999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.08 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.2 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.2 
 
 		 178 aa  115  3e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  35.56 
 
 		 178 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.52 
 
 		 178 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  36.81 
 
 		 181 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.77 
 
 		 181 aa  107  1e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  35.58 
 
 		 179 aa  105  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 180 aa  104  8e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.13 
 
 		 180 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.15 
 
 		 185 aa  98.6  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.41 
 
 		 186 aa  92.4  3e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  29.31 
 
 		 197 aa  86.3  2e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  26.7 
 
 		 196 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  27.01 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  25 
 
 		 177 aa  78.6  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  28 
 
 		 186 aa  78.2  0.00000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  30.77 
 
 		 183 aa  75.9  0.0000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  23.3 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  24.68 
 
 		 194 aa  62.4  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.88 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.49 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.33 
 
 		 194 aa  55.1  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  27.08 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  24.85 
 
 		 176 aa  52.8  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  21.59 
 
 		 437 aa  49.7  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.01 
 
 		 190 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.44 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  24.73 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  26.74 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.54 
 
 		 191 aa  46.2  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  22.76 
 
 		 343 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.29 
 
 		 191 aa  44.7  0.0006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0359  hypothetical protein  25.19 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  25.82 
 
 		 207 aa  43.5  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  25.39 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.53 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.78 
 
 		 194 aa  42.7  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.36 
 
 		 187 aa  42.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>