40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_1277 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 185 aa  375  1e-103  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  70.95 
 
 		 181 aa  259  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  61.75 
 
 		 183 aa  239  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  60.34 
 
 		 180 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  58.66 
 
 		 179 aa  206  2e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  53.59 
 
 		 181 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  56.11 
 
 		 180 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.19 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.24 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.24 
 
 		 178 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.19 
 
 		 178 aa  194  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.19 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  54.19 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.19 
 
 		 178 aa  189  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  55.06 
 
 		 178 aa  188  5e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  55.06 
 
 		 178 aa  187  7e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  33.33 
 
 		 213 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  29.83 
 
 		 183 aa  103  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.15 
 
 		 179 aa  98.6  4e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  28.73 
 
 		 183 aa  92.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  30.59 
 
 		 176 aa  89.7  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.71 
 
 		 186 aa  79.7  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  30.67 
 
 		 183 aa  76.6  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  24.14 
 
 		 177 aa  69.7  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  29.61 
 
 		 186 aa  69.7  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.47 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  25.29 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  25.29 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  24.43 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  26.67 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.73 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0359  hypothetical protein  28.77 
 
 		 191 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.05 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.03 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  23.65 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  27.92 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  24.32 
 
 		 177 aa  45.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.97 
 
 		 183 aa  45.1  0.0006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  26.35 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  21.89 
 
 		 437 aa  42.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>