52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3549 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  100 
 
 		 178 aa  362  2e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  91.01 
 
 		 178 aa  334  3.9999999999999995e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  89.89 
 
 		 178 aa  332  2e-90  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  89.89 
 
 		 178 aa  332  2e-90  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  83.71 
 
 		 178 aa  311  2.9999999999999996e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  82.02 
 
 		 178 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  83.91 
 
 		 178 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  83.91 
 
 		 178 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  82.02 
 
 		 178 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  56.98 
 
 		 181 aa  207  9e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.49 
 
 		 180 aa  205  3e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  54.75 
 
 		 179 aa  198  3.9999999999999996e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  51.96 
 
 		 183 aa  190  9e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  55.06 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  48.88 
 
 		 181 aa  184  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  49.14 
 
 		 180 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.56 
 
 		 179 aa  115  3.9999999999999997e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  34.16 
 
 		 213 aa  111  5e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  33.33 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  32.39 
 
 		 183 aa  103  1e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.34 
 
 		 186 aa  101  7e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  32.69 
 
 		 176 aa  98.2  5e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  36.14 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  27.98 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  30.82 
 
 		 183 aa  72.8  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  29.11 
 
 		 197 aa  72.8  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  24.86 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.19 
 
 		 196 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  27.54 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.71 
 
 		 199 aa  64.3  0.0000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  25 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  27.1 
 
 		 194 aa  63.9  0.000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  24.84 
 
 		 193 aa  57.8  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.9 
 
 		 195 aa  57  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.01 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 194 aa  51.2  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.17 
 
 		 187 aa  49.7  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.87 
 
 		 191 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.08 
 
 		 191 aa  48.1  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.16 
 
 		 194 aa  46.2  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  26.35 
 
 		 343 aa  46.6  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  21.34 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  22.86 
 
 		 437 aa  45.1  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  25.95 
 
 		 207 aa  44.3  0.0009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.83 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.3 
 
 		 747 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  26.98 
 
 		 176 aa  42.4  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  23.49 
 
 		 177 aa  42.7  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.16 
 
 		 182 aa  42  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  26.53 
 
 		 193 aa  41.6  0.005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0359  hypothetical protein  27.91 
 
 		 191 aa  41.6  0.006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  18.95 
 
 		 184 aa  40.8  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>