35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1328 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  100 
 
 
183 aa  368  1e-101  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.08 
 
 
180 aa  78.2  0.00000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.97 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.67 
 
 
185 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  28.67 
 
 
181 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.87 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.87 
 
 
178 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.77 
 
 
179 aa  75.9  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  31.29 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.58 
 
 
180 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.17 
 
 
178 aa  75.1  0.0000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.17 
 
 
178 aa  74.7  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  30.82 
 
 
178 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.68 
 
 
183 aa  73.2  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  29.41 
 
 
176 aa  69.3  0.00000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  27.21 
 
 
183 aa  68.9  0.00000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.47 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.47 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.47 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.47 
 
 
178 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  25.87 
 
 
197 aa  65.5  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  24.84 
 
 
197 aa  64.3  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  28.47 
 
 
213 aa  63.9  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  27.07 
 
 
196 aa  61.6  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.13 
 
 
196 aa  61.2  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  24.81 
 
 
193 aa  58.5  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  26.71 
 
 
183 aa  58.2  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.87 
 
 
186 aa  55.5  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.5 
 
 
191 aa  52.8  0.000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  25.33 
 
 
177 aa  50.8  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  25.3 
 
 
189 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  24.22 
 
 
437 aa  45.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  23.33 
 
 
194 aa  44.7  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.17 
 
 
195 aa  43.1  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1518  hypothetical protein  29.75 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.473183  normal  0.32871 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>