19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1518 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_1518  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  347  5e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.473183  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2508  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  46.01 
 
 		 180 aa  127  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  0.60219 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3136  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  45.71 
 
 		 195 aa  124  5e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1748  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  42.53 
 
 		 185 aa  114  5e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1116  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  42.26 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.53 
 
 		 198 aa  110  8.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703504 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0445  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.77 
 
 		 181 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0436  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.2 
 
 		 181 aa  106  2e-22  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41286  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1688  hypothetical protein  42.46 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00557645  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6190  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.23 
 
 		 184 aa  102  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.375347  normal  0.0187817 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3752  hypothetical protein  35.4 
 
 		 180 aa  85.1  5e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4585  hypothetical protein  39.75 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0363  hemerythrin HHE cation binding protein  31.1 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.55 
 
 		 183 aa  49.3  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5678  hypothetical protein  35.98 
 
 		 194 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  29.75 
 
 		 183 aa  42.4  0.004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3870  hypothetical protein  29.8 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.63 
 
 		 202 aa  41.6  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  34.44 
 
 		 184 aa  41.2  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>