19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_2508 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_2508  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 		 180 aa  362  1e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  0.60219 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1518  hypothetical protein  46.51 
 
 		 179 aa  137  7.999999999999999e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.473183  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3136  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  43.41 
 
 		 195 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.22 
 
 		 198 aa  121  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703504 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1748  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.78 
 
 		 185 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6190  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.64 
 
 		 184 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.375347  normal  0.0187817 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0445  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.78 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0436  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.22 
 
 		 181 aa  109  2.0000000000000002e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41286  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1116  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.24 
 
 		 192 aa  107  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3752  hypothetical protein  40 
 
 		 180 aa  103  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1688  hypothetical protein  37.71 
 
 		 198 aa  102  3e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00557645  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4585  hypothetical protein  39.63 
 
 		 165 aa  101  7e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0363  hemerythrin HHE cation binding protein  30.64 
 
 		 163 aa  64.3  0.0000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.03 
 
 		 183 aa  62.8  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0547  hemerythrin HHE cation binding protein  26.71 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.184109  normal  0.0988011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1355  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.23 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0572311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.7 
 
 		 187 aa  45.8  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1066  hemerythrin HHE cation binding region  35.09 
 
 		 154 aa  41.6  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.602871  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3870  hypothetical protein  29.87 
 
 		 184 aa  41.2  0.007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>