21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_3136 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_3136  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 		 195 aa  390  1e-108  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1748  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  50.86 
 
 		 185 aa  167  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1518  hypothetical protein  45.71 
 
 		 179 aa  124  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.473183  normal  0.32871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2508  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  42.44 
 
 		 180 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.351618  normal  0.60219 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0669  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.22 
 
 		 198 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.703504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1116  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.11 
 
 		 192 aa  103  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6190  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.34 
 
 		 184 aa  103  1e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.375347  normal  0.0187817 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0445  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.15 
 
 		 181 aa  95.9  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0436  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.15 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.41286  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1688  hypothetical protein  37.7 
 
 		 198 aa  88.6  5e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00557645  normal  0.567648 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3752  hypothetical protein  35.47 
 
 		 180 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.984155  normal  0.725799 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4585  hypothetical protein  36.69 
 
 		 165 aa  77.8  0.00000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0363  hemerythrin HHE cation binding protein  31.58 
 
 		 163 aa  67.4  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0827  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.95 
 
 		 183 aa  53.9  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1743  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.58 
 
 		 189 aa  44.3  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000243093 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1711  hemerythrin HHE cation binding protein  29.31 
 
 		 182 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0954162  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3870  hypothetical protein  33.63 
 
 		 184 aa  44.3  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.766123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1607  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.93 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253535  normal  0.616262 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5678  hypothetical protein  35.9 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1782  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.31 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  33.61 
 
 		 437 aa  42  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>