51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_1209 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 195 aa  391  1e-108  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  53.68 
 
 		 191 aa  208  3e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  52.85 
 
 		 194 aa  207  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  48.44 
 
 		 207 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  46.67 
 
 		 222 aa  166  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  45.03 
 
 		 193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  44.85 
 
 		 198 aa  160  8.000000000000001e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  42.71 
 
 		 191 aa  155  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  46.71 
 
 		 176 aa  150  8e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  43.62 
 
 		 189 aa  147  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 194 aa  135  3.0000000000000003e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  40.53 
 
 		 194 aa  134  6.0000000000000005e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.81 
 
 		 190 aa  134  7.000000000000001e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.49 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  36.79 
 
 		 196 aa  131  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  38.83 
 
 		 437 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.89 
 
 		 191 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  36.97 
 
 		 193 aa  89.4  3e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  35.22 
 
 		 343 aa  84.7  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.35 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  27.78 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  28.33 
 
 		 197 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.42 
 
 		 196 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  27.27 
 
 		 196 aa  71.2  0.000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  29.14 
 
 		 183 aa  61.6  0.000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  28.25 
 
 		 213 aa  61.6  0.000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  28.89 
 
 		 183 aa  61.2  0.000000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 178 aa  61.2  0.000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 178 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.49 
 
 		 179 aa  60.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.99 
 
 		 178 aa  61.2  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.64 
 
 		 178 aa  58.2  0.00000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.99 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.32 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  28.9 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  30.17 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.75 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.75 
 
 		 178 aa  55.8  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  28.38 
 
 		 181 aa  52.4  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  29.63 
 
 		 177 aa  51.6  0.000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 177 aa  51.2  0.000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.61 
 
 		 747 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0359  hypothetical protein  30.71 
 
 		 191 aa  47.4  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.65 
 
 		 187 aa  46.6  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.63 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  21.23 
 
 		 176 aa  45.4  0.0005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7174  hypothetical protein  32.93 
 
 		 307 aa  44.3  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  25.17 
 
 		 183 aa  43.1  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  35.09 
 
 		 507 aa  42.4  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.28 
 
 		 183 aa  41.2  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>