52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3249 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
178 aa  362  1e-99  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 
178 aa  362  1e-99  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  99.44 
 
 
178 aa  360  6e-99  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  98.88 
 
 
178 aa  358  2e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  85.14 
 
 
178 aa  310  4.999999999999999e-84  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  82.58 
 
 
178 aa  308  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  80.9 
 
 
178 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  80.9 
 
 
178 aa  306  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  83.91 
 
 
178 aa  305  2.0000000000000002e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  60.57 
 
 
181 aa  214  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  55.06 
 
 
180 aa  206  1e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  53.63 
 
 
179 aa  199  1.9999999999999998e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  53.07 
 
 
183 aa  192  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.19 
 
 
185 aa  193  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  50 
 
 
181 aa  192  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  49.72 
 
 
180 aa  181  6e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.47 
 
 
179 aa  117  7e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  33.33 
 
 
183 aa  112  3e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  33.12 
 
 
183 aa  111  5e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  31.87 
 
 
213 aa  107  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  30.36 
 
 
176 aa  97.8  6e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.53 
 
 
186 aa  97.4  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  28.49 
 
 
197 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  29.48 
 
 
197 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.49 
 
 
196 aa  82.4  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  25 
 
 
177 aa  80.9  0.000000000000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  33.13 
 
 
186 aa  80.5  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  26.7 
 
 
196 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.48 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  31.47 
 
 
183 aa  67.8  0.00000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  25.47 
 
 
193 aa  65.9  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  26.14 
 
 
194 aa  64.3  0.0000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.99 
 
 
195 aa  61.2  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  25.15 
 
 
196 aa  58.9  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.05 
 
 
191 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.29 
 
 
191 aa  55.5  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.31 
 
 
187 aa  48.1  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.17 
 
 
194 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  26.92 
 
 
207 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.77 
 
 
191 aa  46.6  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.83 
 
 
190 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  25.5 
 
 
177 aa  46.6  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  21.47 
 
 
437 aa  45.8  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  25.83 
 
 
176 aa  45.8  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  22.22 
 
 
183 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.16 
 
 
194 aa  42.4  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.47 
 
 
747 aa  42.4  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.66 
 
 
182 aa  42  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  19.61 
 
 
184 aa  41.6  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  23.46 
 
 
189 aa  41.2  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  25 
 
 
183 aa  41.2  0.008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  26.76 
 
 
198 aa  41.2  0.009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>