42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_2903 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 180 aa  370  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  55.31 
 
 		 183 aa  222  3e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  57.39 
 
 		 181 aa  214  5e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  56.18 
 
 		 178 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  56.18 
 
 		 178 aa  211  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.49 
 
 		 178 aa  207  9e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  55.06 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  55.06 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  55.06 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  55.06 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  51.4 
 
 		 181 aa  205  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  54.49 
 
 		 178 aa  205  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  52.25 
 
 		 178 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  53.63 
 
 		 179 aa  197  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  56.11 
 
 		 185 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  53.33 
 
 		 180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.15 
 
 		 179 aa  104  8e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  30.73 
 
 		 183 aa  103  9e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  30.73 
 
 		 183 aa  99.4  2e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  30.67 
 
 		 213 aa  98.2  5e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  30.86 
 
 		 176 aa  90.9  8e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  28.98 
 
 		 196 aa  84.7  7e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.99 
 
 		 186 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  26.14 
 
 		 197 aa  80.9  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  31.08 
 
 		 183 aa  78.2  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.04 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  25.57 
 
 		 193 aa  74.7  0.0000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  25 
 
 		 177 aa  73.9  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  24.43 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  31.18 
 
 		 186 aa  65.1  0.0000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0359  hypothetical protein  33.08 
 
 		 191 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  26.79 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  26.24 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.68 
 
 		 199 aa  50.4  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.81 
 
 		 191 aa  47.8  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  22.45 
 
 		 343 aa  47.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.76 
 
 		 191 aa  43.9  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.17 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.11 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  27.27 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2519  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.75 
 
 		 232 aa  42  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  32.89 
 
 		 177 aa  40.8  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>