46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7075 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 191 aa  387  1e-107  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  55.74 
 
 		 190 aa  212  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  56.28 
 
 		 194 aa  206  2e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.56 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  40.11 
 
 		 193 aa  130  9e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  38.59 
 
 		 207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  41.05 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.36 
 
 		 194 aa  127  1.0000000000000001e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  42.18 
 
 		 176 aa  122  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.56 
 
 		 191 aa  121  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.89 
 
 		 195 aa  118  4.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  36.96 
 
 		 189 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.16 
 
 		 199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  33.88 
 
 		 196 aa  107  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  31.96 
 
 		 222 aa  106  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  31.69 
 
 		 194 aa  89.7  2e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  30.39 
 
 		 437 aa  88.6  5e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  35.06 
 
 		 343 aa  79  0.00000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  29.89 
 
 		 197 aa  72.4  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  29.35 
 
 		 197 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  22.78 
 
 		 196 aa  67.8  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.89 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.81 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  24.18 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 178 aa  57.4  0.0000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.05 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.05 
 
 		 178 aa  57  0.0000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.1 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7174  hypothetical protein  29.94 
 
 		 307 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.66 
 
 		 178 aa  55.5  0.0000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.17 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.33 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.33 
 
 		 178 aa  52.8  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  27.75 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.32 
 
 		 187 aa  51.2  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  28.87 
 
 		 178 aa  49.3  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  27.21 
 
 		 177 aa  49.3  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  26.72 
 
 		 177 aa  48.9  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  21.77 
 
 		 181 aa  45.4  0.0005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.29 
 
 		 179 aa  44.7  0.0007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.16 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.17 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  20.48 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.33 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  27.78 
 
 		 183 aa  42.4  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>