45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_7174 on replicon NC_010625
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_7174  hypothetical protein  100 
 
 		 307 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  37.16 
 
 		 343 aa  150  3e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1584  hypothetical protein  37.22 
 
 		 313 aa  122  8e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1603  hypothetical protein  39.14 
 
 		 313 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193621 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2331  hypothetical protein  39.13 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3098  hypothetical protein  39.13 
 
 		 353 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1349  hypothetical protein  39.13 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1064  hypothetical protein  39.13 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1437  hypothetical protein  39.13 
 
 		 353 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.73 
 
 		 191 aa  65.1  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2040  hypothetical protein  55.36 
 
 		 63 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.83 
 
 		 190 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.94 
 
 		 191 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.11 
 
 		 194 aa  53.5  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.84 
 
 		 191 aa  51.6  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  29.66 
 
 		 143 aa  50.8  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.49 
 
 		 199 aa  50.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  28.21 
 
 		 196 aa  49.3  0.00009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  29.82 
 
 		 144 aa  48.5  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2524  UspA domain-containing protein  31.86 
 
 		 149 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  27.44 
 
 		 189 aa  48.9  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  48.94 
 
 		 193 aa  47.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  31.58 
 
 		 144 aa  47  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  33.33 
 
 		 144 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1112  hypothetical protein  34.52 
 
 		 144 aa  46.2  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.619921  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1387  hypothetical protein  30.17 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00373989  normal  0.527764 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3980  universal stress protein  29.84 
 
 		 149 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2081  UspA domain-containing protein  32.46 
 
 		 144 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  32.46 
 
 		 144 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1951  UspA domain-containing protein  32.46 
 
 		 144 aa  45.4  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.348575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3338  UspA domain-containing protein  28.57 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  30.7 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  30.7 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0991  hypothetical protein  26.71 
 
 		 147 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  30.7 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.93 
 
 		 195 aa  44.7  0.002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  30.7 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  30.7 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  30.7 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  30.7 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1954  hypothetical protein  30.17 
 
 		 144 aa  43.9  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  26.52 
 
 		 197 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  30 
 
 		 193 aa  43.5  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  29.06 
 
 		 147 aa  43.1  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1650  universal stress protein  30.7 
 
 		 144 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.629264  normal  0.0236614 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>