59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_1521 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 
199 aa  399  9.999999999999999e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  55 
 
 
194 aa  201  4e-51  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  43.81 
 
 
191 aa  167  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  43.46 
 
 
189 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.49 
 
 
195 aa  134  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  38.14 
 
 
196 aa  129  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.02 
 
 
191 aa  128  5.0000000000000004e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.06 
 
 
194 aa  127  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.87 
 
 
190 aa  123  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.95 
 
 
194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  36.68 
 
 
222 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  36.36 
 
 
437 aa  112  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.16 
 
 
191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  32.47 
 
 
193 aa  104  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  32.81 
 
 
207 aa  102  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  34.54 
 
 
198 aa  100  2e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  33.97 
 
 
176 aa  88.6  6e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  32.67 
 
 
197 aa  79.7  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  32.08 
 
 
197 aa  79.3  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  31.41 
 
 
343 aa  78.6  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30 
 
 
196 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  29.01 
 
 
183 aa  72.8  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.48 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.48 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.48 
 
 
178 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.48 
 
 
178 aa  72  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.63 
 
 
186 aa  68.9  0.00000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  27.33 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  30.13 
 
 
193 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  27.16 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.67 
 
 
178 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.71 
 
 
178 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  27.71 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.71 
 
 
178 aa  64.7  0.000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.11 
 
 
178 aa  64.3  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  25.47 
 
 
181 aa  60.8  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.88 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  27.41 
 
 
176 aa  58.2  0.00000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  28.31 
 
 
213 aa  55.5  0.0000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  27.85 
 
 
179 aa  55.8  0.0000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  27.95 
 
 
177 aa  54.7  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.09 
 
 
183 aa  53.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.79 
 
 
180 aa  51.2  0.000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  27.22 
 
 
186 aa  50.8  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7174  hypothetical protein  29.49 
 
 
307 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.68 
 
 
180 aa  50.4  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.05 
 
 
185 aa  49.7  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.11 
 
 
182 aa  49.7  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.2 
 
 
181 aa  49.3  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  23.57 
 
 
177 aa  49.3  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  30.28 
 
 
212 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.83 
 
 
187 aa  47  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  26.95 
 
 
180 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  23.61 
 
 
183 aa  45.1  0.0006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0955  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.29 
 
 
236 aa  45.1  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  23.65 
 
 
184 aa  44.7  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.63 
 
 
747 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.9 
 
 
177 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.21 
 
 
218 aa  42  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>