45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0760 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
177 aa  360  5.0000000000000005e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0395  hypothetical protein  50.31 
 
 
163 aa  156  1e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  32.73 
 
 
177 aa  88.2  6e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  29.61 
 
 
184 aa  86.3  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.29 
 
 
185 aa  80.9  0.000000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  32.18 
 
 
188 aa  77  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.1 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.62 
 
 
184 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 
187 aa  76.6  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.4 
 
 
182 aa  75.5  0.0000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.33 
 
 
187 aa  74.7  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.04 
 
 
182 aa  74.3  0.0000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.28 
 
 
184 aa  72  0.000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  34.64 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.78 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.62 
 
 
184 aa  68.6  0.00000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  27.22 
 
 
183 aa  66.6  0.0000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0288  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.81 
 
 
178 aa  64.3  0.0000000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00932018 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  26.59 
 
 
201 aa  63.9  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.76 
 
 
191 aa  62.4  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.27 
 
 
202 aa  61.6  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.82 
 
 
187 aa  61.6  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.91 
 
 
180 aa  61.2  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.82 
 
 
202 aa  60.8  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.49 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.86 
 
 
191 aa  59.7  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.5 
 
 
179 aa  58.5  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.71 
 
 
190 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.26 
 
 
182 aa  57.8  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  28.05 
 
 
180 aa  55.1  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.17 
 
 
191 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.81 
 
 
195 aa  51.2  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.68 
 
 
316 aa  50.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.23 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  23.57 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0292536 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.6 
 
 
176 aa  45.4  0.0004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  24.32 
 
 
196 aa  45.1  0.0005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.42 
 
 
194 aa  44.3  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  28.81 
 
 
176 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12027  hypothetical protein  23.84 
 
 
255 aa  43.9  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000558386  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  25 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1323  hypothetical protein  24.31 
 
 
235 aa  43.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.9 
 
 
199 aa  42.7  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  27.15 
 
 
189 aa  41.2  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1607  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.22 
 
 
188 aa  40.8  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.253535  normal  0.616262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>