57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_2830 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 		 194 aa  393  1e-108  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  59.69 
 
 		 191 aa  243  9.999999999999999e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  55.33 
 
 		 198 aa  211  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  52.85 
 
 		 195 aa  207  1e-52  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  53.61 
 
 		 193 aa  202  2e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  54.64 
 
 		 207 aa  201  4e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  53.81 
 
 		 222 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  51.7 
 
 		 176 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  43.32 
 
 		 189 aa  140  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  41.24 
 
 		 191 aa  139  1.9999999999999998e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.91 
 
 		 190 aa  136  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.78 
 
 		 194 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.36 
 
 		 191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.06 
 
 		 199 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  37.89 
 
 		 196 aa  122  3e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  36.02 
 
 		 437 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  35.79 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  30.87 
 
 		 193 aa  75.1  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  29.75 
 
 		 343 aa  72.8  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.96 
 
 		 186 aa  72  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  27.93 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.28 
 
 		 218 aa  62  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  25.84 
 
 		 196 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.72 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  27.37 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  28.4 
 
 		 177 aa  56.6  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  32.08 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.33 
 
 		 179 aa  55.1  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  27.33 
 
 		 183 aa  54.7  0.0000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  27.61 
 
 		 212 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  24.71 
 
 		 181 aa  52.8  0.000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.59 
 
 		 184 aa  51.6  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.4 
 
 		 184 aa  50.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  26.63 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.17 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.17 
 
 		 178 aa  47.4  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  26.97 
 
 		 183 aa  47  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  26.7 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25 
 
 		 178 aa  47  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  24.16 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.83 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.83 
 
 		 178 aa  45.8  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.46 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.06 
 
 		 187 aa  43.9  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 557 aa  44.3  0.001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.95 
 
 		 747 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.66 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.42 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  25 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  28.29 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1748  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.38 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.268511 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  24.11 
 
 		 176 aa  42.7  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  31.82 
 
 		 543 aa  42.4  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7174  hypothetical protein  23.23 
 
 		 307 aa  42  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0955  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.63 
 
 		 236 aa  41.6  0.008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>