53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_1756 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 		 177 aa  362  1e-99  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  35.03 
 
 		 197 aa  117  6e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.2 
 
 		 196 aa  107  1e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  31.07 
 
 		 196 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  32.77 
 
 		 197 aa  105  5e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  31.21 
 
 		 193 aa  98.2  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.25 
 
 		 186 aa  94.4  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  31.07 
 
 		 186 aa  93.2  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  26.14 
 
 		 181 aa  89.4  3e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.57 
 
 		 178 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  25.73 
 
 		 183 aa  81.3  0.000000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25 
 
 		 178 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.44 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25 
 
 		 179 aa  78.6  0.00000000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  26.32 
 
 		 213 aa  78.2  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.42 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  24.12 
 
 		 176 aa  76.6  0.0000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.86 
 
 		 178 aa  75.5  0.0000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  25.15 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25 
 
 		 180 aa  73.9  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  24.86 
 
 		 178 aa  72.4  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.86 
 
 		 178 aa  71.6  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.8 
 
 		 191 aa  70.5  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.14 
 
 		 185 aa  69.7  0.00000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  23.3 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.86 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.86 
 
 		 178 aa  69.3  0.00000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  31.21 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  28.49 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  28.16 
 
 		 437 aa  65.5  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0359  hypothetical protein  34.11 
 
 		 191 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  29.65 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  30.3 
 
 		 176 aa  63.9  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  28.92 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  26.82 
 
 		 189 aa  61.6  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.75 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  25.45 
 
 		 196 aa  60.8  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.6 
 
 		 183 aa  60.1  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.06 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.4 
 
 		 194 aa  56.6  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.95 
 
 		 199 aa  54.7  0.0000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.63 
 
 		 195 aa  51.6  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  25.33 
 
 		 183 aa  50.8  0.000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  27.62 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.72 
 
 		 191 aa  48.9  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.93 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  26.9 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  25.19 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.81 
 
 		 187 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.81 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0570  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.34 
 
 		 154 aa  41.2  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>