61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_0910 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 		 194 aa  391  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  55 
 
 		 199 aa  201  4e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.53 
 
 		 195 aa  134  6.0000000000000005e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  39.79 
 
 		 191 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  36.65 
 
 		 196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.65 
 
 		 191 aa  114  8.999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  38.1 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.79 
 
 		 194 aa  111  7.000000000000001e-24  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  32.11 
 
 		 193 aa  104  9e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  32.45 
 
 		 207 aa  102  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  34.74 
 
 		 198 aa  101  6e-21  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.97 
 
 		 190 aa  101  8e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.88 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  34.21 
 
 		 437 aa  99  4e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  33.85 
 
 		 222 aa  94.7  7e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.69 
 
 		 191 aa  89.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  30.51 
 
 		 176 aa  84  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  31.29 
 
 		 343 aa  75.1  0.0000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  27.68 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  27.81 
 
 		 196 aa  70.9  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.63 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  31.21 
 
 		 177 aa  66.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  26.22 
 
 		 197 aa  65.9  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  27.33 
 
 		 213 aa  65.9  0.0000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 178 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.42 
 
 		 178 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  28.19 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.42 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.49 
 
 		 178 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.14 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  27.1 
 
 		 178 aa  63.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.14 
 
 		 178 aa  64.3  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  29.93 
 
 		 183 aa  63.2  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.68 
 
 		 179 aa  62.4  0.000000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.39 
 
 		 186 aa  58.9  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.45 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.45 
 
 		 178 aa  59.3  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.06 
 
 		 180 aa  57  0.0000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  28.1 
 
 		 183 aa  56.2  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.14 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  23.78 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.24 
 
 		 180 aa  52.8  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  29.55 
 
 		 176 aa  50.8  0.00001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.37 
 
 		 187 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  29.37 
 
 		 179 aa  50.1  0.00002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  27.81 
 
 		 184 aa  48.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  28.21 
 
 		 186 aa  48.1  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.65 
 
 		 185 aa  47.8  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  24.49 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0395  hypothetical protein  27.27 
 
 		 163 aa  46.2  0.0003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  23.33 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.17 
 
 		 183 aa  44.7  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  22.54 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  27.52 
 
 		 543 aa  43.1  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0536  hypothetical protein  25.47 
 
 		 156 aa  43.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0359  hypothetical protein  26.17 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.64 
 
 		 222 aa  42.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  21.58 
 
 		 187 aa  41.6  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.71 
 
 		 182 aa  41.2  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  23.29 
 
 		 213 aa  41.2  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.86 
 
 		 747 aa  41.2  0.01  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.105486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>