53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1774 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 
186 aa  377  1e-104  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  62.09 
 
 
186 aa  243  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  32.6 
 
 
196 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  33.89 
 
 
197 aa  106  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  32.78 
 
 
197 aa  104  6e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  31.61 
 
 
177 aa  102  3e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.67 
 
 
196 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  36.75 
 
 
178 aa  94.7  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.14 
 
 
178 aa  94.7  7e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.14 
 
 
178 aa  92  4e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.94 
 
 
178 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.94 
 
 
178 aa  92  5e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.94 
 
 
178 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.94 
 
 
178 aa  91.7  5e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.34 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.34 
 
 
178 aa  90.5  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.79 
 
 
180 aa  87  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  29.94 
 
 
193 aa  85.5  4e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.78 
 
 
181 aa  83.6  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.76 
 
 
183 aa  82.4  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.57 
 
 
179 aa  81.6  0.000000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  30.54 
 
 
181 aa  80.9  0.000000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  30.54 
 
 
179 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.17 
 
 
185 aa  78.6  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.18 
 
 
180 aa  75.9  0.0000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.57 
 
 
191 aa  72.8  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  26.19 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.17 
 
 
195 aa  69.7  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  24.85 
 
 
176 aa  68.9  0.00000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.73 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  28.77 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  28.91 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  24.43 
 
 
213 aa  64.3  0.0000000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.32 
 
 
191 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.63 
 
 
194 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  27.16 
 
 
193 aa  62.4  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.29 
 
 
190 aa  62  0.000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  25 
 
 
183 aa  61.2  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  28.15 
 
 
176 aa  61.2  0.000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  30.77 
 
 
196 aa  60.8  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.81 
 
 
199 aa  59.7  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  33.08 
 
 
437 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  28.31 
 
 
189 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  27.27 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0359  hypothetical protein  29.53 
 
 
191 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.85 
 
 
194 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  28.69 
 
 
194 aa  50.1  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7174  hypothetical protein  31.69 
 
 
307 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.08 
 
 
183 aa  48.1  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.49 
 
 
187 aa  47  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  24.26 
 
 
183 aa  41.6  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.68 
 
 
184 aa  41.6  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.39 
 
 
202 aa  41.2  0.01  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>