41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00946 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  100 
 
 		 183 aa  371  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  85.79 
 
 		 183 aa  323  1e-87  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  63.93 
 
 		 213 aa  240  9e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  46.59 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.11 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.12 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.12 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.12 
 
 		 178 aa  111  5e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.12 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 178 aa  105  3e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  32.39 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  32.39 
 
 		 178 aa  103  1e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.41 
 
 		 181 aa  102  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.17 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 178 aa  100  8e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.73 
 
 		 180 aa  99.4  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  31.07 
 
 		 179 aa  99  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  32.12 
 
 		 181 aa  99.4  3e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.73 
 
 		 185 aa  92.4  3e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  28.07 
 
 		 197 aa  84.7  6e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.65 
 
 		 196 aa  84.3  8e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  26.9 
 
 		 197 aa  84  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  28.07 
 
 		 196 aa  82  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  26.32 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.14 
 
 		 180 aa  79.7  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.44 
 
 		 186 aa  77.8  0.00000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  25.15 
 
 		 177 aa  75.1  0.0000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.16 
 
 		 199 aa  66.6  0.0000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.89 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  24.42 
 
 		 437 aa  60.1  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  26.71 
 
 		 183 aa  58.2  0.00000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  28.1 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  24.4 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.01 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.72 
 
 		 191 aa  51.2  0.000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  25.88 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.7 
 
 		 194 aa  47.4  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  23.7 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  25.84 
 
 		 198 aa  41.6  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0359  hypothetical protein  22.92 
 
 		 191 aa  40.8  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>