43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_1071 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 183 aa  375  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  61.75 
 
 		 185 aa  239  2e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  60.8 
 
 		 181 aa  228  3e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  55.31 
 
 		 180 aa  222  3e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  57.54 
 
 		 180 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  55.87 
 
 		 178 aa  201  5e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  55.31 
 
 		 179 aa  201  6e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.75 
 
 		 178 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.75 
 
 		 178 aa  200  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  53.63 
 
 		 178 aa  195  3e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  53.63 
 
 		 178 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  55.43 
 
 		 178 aa  194  7e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  50.84 
 
 		 181 aa  194  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  53.07 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  53.07 
 
 		 178 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  51.96 
 
 		 178 aa  190  9e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  31.84 
 
 		 183 aa  110  1.0000000000000001e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.71 
 
 		 179 aa  103  1e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  30.17 
 
 		 183 aa  102  3e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  29.45 
 
 		 213 aa  97.1  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  31.61 
 
 		 176 aa  90.5  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.18 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  27.84 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  27.68 
 
 		 183 aa  73.2  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  27.27 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  27.17 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.09 
 
 		 196 aa  68.6  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  31.76 
 
 		 186 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  26.42 
 
 		 193 aa  62.4  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  22.6 
 
 		 177 aa  60.1  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.09 
 
 		 199 aa  53.5  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.07 
 
 		 191 aa  47.8  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  28.47 
 
 		 437 aa  45.4  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  25.17 
 
 		 194 aa  44.7  0.0008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  25.19 
 
 		 176 aa  44.3  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.32 
 
 		 182 aa  43.5  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26 
 
 		 191 aa  42.7  0.003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  22.58 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.36 
 
 		 187 aa  42.7  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.42 
 
 		 184 aa  42.4  0.004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.12 
 
 		 182 aa  42  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.28 
 
 		 195 aa  41.2  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0359  hypothetical protein  24.63 
 
 		 191 aa  41.2  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>