50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_1515 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 		 176 aa  361  3e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  71.84 
 
 		 193 aa  264  5e-70  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  71.84 
 
 		 198 aa  262  2e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  68.57 
 
 		 207 aa  249  2e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  54.6 
 
 		 191 aa  195  2.0000000000000003e-49  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  51.7 
 
 		 194 aa  177  4.999999999999999e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  46.71 
 
 		 195 aa  150  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  48.63 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  42.18 
 
 		 191 aa  122  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  41.5 
 
 		 190 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.18 
 
 		 191 aa  107  8.000000000000001e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  36.42 
 
 		 189 aa  103  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  37.18 
 
 		 196 aa  102  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  36.2 
 
 		 437 aa  101  7e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  39.73 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.97 
 
 		 199 aa  88.6  4e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  30.51 
 
 		 194 aa  84  0.000000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  28.57 
 
 		 193 aa  69.3  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  29.46 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.26 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  30.3 
 
 		 177 aa  63.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  31.54 
 
 		 197 aa  62.4  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  32.31 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.68 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  29.06 
 
 		 343 aa  57.8  0.00000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.85 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  27.08 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  35.29 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  25.62 
 
 		 177 aa  47.8  0.00008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  28.15 
 
 		 186 aa  47.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  26.97 
 
 		 185 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.83 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.83 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.83 
 
 		 178 aa  45.8  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.83 
 
 		 178 aa  46.2  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  27.93 
 
 		 180 aa  45.1  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.19 
 
 		 183 aa  44.3  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.01 
 
 		 185 aa  44.3  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.81 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.29 
 
 		 182 aa  43.9  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 		 222 aa  43.9  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  27.59 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  26.98 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.15 
 
 		 180 aa  42.4  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.99 
 
 		 187 aa  42  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  26.28 
 
 		 183 aa  42  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.67 
 
 		 178 aa  42  0.005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  26.52 
 
 		 213 aa  41.2  0.007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.19 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  24.43 
 
 		 188 aa  40.8  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>