24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0499 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 		 222 aa  450  1.0000000000000001e-126  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.19 
 
 		 218 aa  141  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  34.93 
 
 		 212 aa  125  4.0000000000000003e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1115  hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.82 
 
 		 241 aa  117  9.999999999999999e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4061  hypothetical protein  32.69 
 
 		 232 aa  111  8.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0644782  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1048  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.84 
 
 		 241 aa  108  8.000000000000001e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0955  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.48 
 
 		 236 aa  100  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  29.49 
 
 		 747 aa  76.6  0.0000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0785  hypothetical protein  29.28 
 
 		 243 aa  75.1  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1243  hypothetical protein  27.27 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407567  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  26.88 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3557  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.67 
 
 		 219 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5446  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.44 
 
 		 215 aa  64.3  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5843  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.44 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.737154  normal  0.680441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2034  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  30.56 
 
 		 216 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.568645 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 531 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  30.4 
 
 		 437 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32 
 
 		 194 aa  53.5  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2125  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.89 
 
 		 284 aa  48.9  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0724883  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.46 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.33 
 
 		 274 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  28.57 
 
 		 176 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  33.64 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  31.31 
 
 		 196 aa  42.4  0.006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>