70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_2455 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 		 196 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.08 
 
 		 191 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.79 
 
 		 195 aa  131  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  38.14 
 
 		 199 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.9 
 
 		 191 aa  127  8.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  36.65 
 
 		 189 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.68 
 
 		 190 aa  125  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.89 
 
 		 194 aa  122  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  36.65 
 
 		 194 aa  118  4.9999999999999996e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  34.54 
 
 		 222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  34.55 
 
 		 207 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  35.29 
 
 		 198 aa  109  3e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  34.74 
 
 		 193 aa  108  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.88 
 
 		 191 aa  107  9.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  34.92 
 
 		 437 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  37.18 
 
 		 176 aa  102  4e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.15 
 
 		 194 aa  101  7e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  31.61 
 
 		 343 aa  84.7  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  29.44 
 
 		 196 aa  78.2  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.74 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25 
 
 		 196 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  25 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  25.56 
 
 		 197 aa  65.5  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  27.54 
 
 		 178 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  24.72 
 
 		 183 aa  63.5  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.22 
 
 		 186 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  26.6 
 
 		 184 aa  63.2  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.95 
 
 		 178 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.95 
 
 		 178 aa  62  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.35 
 
 		 178 aa  62  0.000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  24.59 
 
 		 185 aa  61.2  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  26.95 
 
 		 181 aa  61.2  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  25.45 
 
 		 177 aa  60.8  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  27.59 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.15 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.15 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.15 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.15 
 
 		 178 aa  58.9  0.00000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.08 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.53 
 
 		 180 aa  53.9  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  23.56 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.79 
 
 		 180 aa  53.9  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  26.59 
 
 		 183 aa  52.4  0.000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  27.65 
 
 		 179 aa  51.2  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.94 
 
 		 181 aa  50.8  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  22.75 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.23 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  21.74 
 
 		 187 aa  49.3  0.00003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7174  hypothetical protein  28.21 
 
 		 307 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  25.88 
 
 		 183 aa  49.3  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0359  hypothetical protein  29.55 
 
 		 191 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.17 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  22.22 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.23 
 
 		 187 aa  48.5  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  23.53 
 
 		 182 aa  48.1  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  19.89 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  29.29 
 
 		 557 aa  46.2  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.39 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  31.37 
 
 		 531 aa  45.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  30.77 
 
 		 186 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.32 
 
 		 177 aa  45.1  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  31.43 
 
 		 543 aa  44.7  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  28.44 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  22.54 
 
 		 176 aa  44.7  0.0009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.68 
 
 		 183 aa  42.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  23.2 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.47 
 
 		 747 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  26.06 
 
 		 213 aa  43.1  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.5 
 
 		 182 aa  42.4  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.31 
 
 		 222 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>