57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1196 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 		 182 aa  368  1e-101  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  51.09 
 
 		 184 aa  174  6e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  46.74 
 
 		 184 aa  157  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  44.51 
 
 		 183 aa  147  6e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  41.49 
 
 		 184 aa  131  5e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.57 
 
 		 202 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  37.57 
 
 		 201 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  37.02 
 
 		 202 aa  98.2  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.15 
 
 		 202 aa  96.3  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  30.6 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  33.15 
 
 		 180 aa  74.7  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.98 
 
 		 184 aa  72  0.000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.33 
 
 		 176 aa  70.5  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.11 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  29.73 
 
 		 177 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.06 
 
 		 185 aa  66.2  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.11 
 
 		 187 aa  66.6  0.0000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.13 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.82 
 
 		 187 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  26.39 
 
 		 188 aa  62  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.91 
 
 		 316 aa  61.6  0.000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.68 
 
 		 180 aa  61.2  0.000000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  26.82 
 
 		 437 aa  61.2  0.000000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.49 
 
 		 177 aa  60.5  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.01 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.37 
 
 		 183 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.38 
 
 		 185 aa  60.1  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.86 
 
 		 182 aa  59.7  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  25.16 
 
 		 188 aa  58.9  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0288  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.78 
 
 		 178 aa  53.5  0.000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00932018 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12027  hypothetical protein  24.58 
 
 		 255 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000558386  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.33 
 
 		 191 aa  52  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.11 
 
 		 199 aa  49.7  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2519  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.29 
 
 		 232 aa  48.1  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  23.53 
 
 		 196 aa  48.1  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.28 
 
 		 177 aa  47  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000541236  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.63 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.46 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  25.81 
 
 		 180 aa  44.7  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  26.86 
 
 		 189 aa  44.3  0.0009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3104  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.59 
 
 		 257 aa  43.9  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  20.48 
 
 		 191 aa  43.5  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  25 
 
 		 207 aa  43.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  25 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.11 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.32 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  25.16 
 
 		 178 aa  42  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  24.69 
 
 		 198 aa  42  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.66 
 
 		 178 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.31 
 
 		 196 aa  42  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.66 
 
 		 178 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.74 
 
 		 178 aa  42  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.66 
 
 		 178 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.66 
 
 		 178 aa  42  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.7 
 
 		 194 aa  41.2  0.008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  25.71 
 
 		 194 aa  41.2  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>