42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1012 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  100 
 
 		 180 aa  366  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  44.12 
 
 		 177 aa  157  8e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  36.36 
 
 		 184 aa  100  8e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.88 
 
 		 316 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.82 
 
 		 185 aa  93.2  2e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  31.25 
 
 		 184 aa  90.5  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.65 
 
 		 187 aa  88.6  4e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  33.53 
 
 		 183 aa  87.4  1e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.32 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.11 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.55 
 
 		 184 aa  80.5  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  26.16 
 
 		 188 aa  80.5  0.00000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  31.15 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.56 
 
 		 202 aa  77  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.17 
 
 		 202 aa  76.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.57 
 
 		 182 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.15 
 
 		 182 aa  74.7  0.0000000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  25.84 
 
 		 188 aa  72.8  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  24.57 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  29.05 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0292536 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.43 
 
 		 176 aa  68.2  0.00000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.88 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.19 
 
 		 182 aa  64.3  0.0000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.21 
 
 		 179 aa  58.9  0.00000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  26.24 
 
 		 437 aa  55.5  0.0000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.05 
 
 		 177 aa  55.1  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0395  hypothetical protein  28.68 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.45 
 
 		 191 aa  53.9  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0288  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.9 
 
 		 178 aa  51.2  0.000008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00932018 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.26 
 
 		 187 aa  50.8  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1323  hypothetical protein  24.84 
 
 		 235 aa  48.1  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.95 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3104  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.98 
 
 		 257 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.32 
 
 		 184 aa  44.7  0.0006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  23.75 
 
 		 191 aa  43.5  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1527  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.98 
 
 		 177 aa  43.9  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000541236  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.67 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.05 
 
 		 187 aa  42  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  22.56 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1580  putative PAS/PAC sensor protein  26.19 
 
 		 406 aa  41.6  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2519  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.19 
 
 		 232 aa  41.2  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  22.09 
 
 		 193 aa  41.2  0.008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>