41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_0505 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009376  Pars_0505  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 
180 aa  375  1e-103  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.581987  normal  0.213341 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1917  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  69.1 
 
 
179 aa  269  1e-71  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0288  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  40.8 
 
 
178 aa  137  7e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.00932018 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2937  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  34.32 
 
 
184 aa  89.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  28.41 
 
 
184 aa  87.4  9e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3018  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.28 
 
 
183 aa  84.3  7e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.850698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1232  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.01 
 
 
187 aa  82.8  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000355045 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3145  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.77 
 
 
316 aa  80.9  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2428  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.82 
 
 
202 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0824334 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1610  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 
185 aa  75.9  0.0000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2551  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.43 
 
 
202 aa  75.9  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1402  hemerythrin HHE cation binding protein  28.92 
 
 
201 aa  74.3  0.0000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2455  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.52 
 
 
202 aa  73.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.704463  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2650  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.17 
 
 
182 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.567158  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2661  hypothetical protein  30.77 
 
 
188 aa  72  0.000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0260  hemerythrin HHE cation binding protein  32.59 
 
 
183 aa  71.2  0.000000000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2516  hemerythrin HHE cation binding region  33.1 
 
 
188 aa  71.2  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.74757  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0771  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.99 
 
 
185 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0221  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.39 
 
 
182 aa  68.2  0.00000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000313734  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1012  hemerythrin HHE cation binding region  30.13 
 
 
180 aa  65.9  0.0000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1164  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.34 
 
 
184 aa  65.9  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1196  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.68 
 
 
182 aa  64.7  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.406056  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0760  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.97 
 
 
177 aa  63.5  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000791976  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2614  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.33 
 
 
176 aa  63.2  0.000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.587772  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1597  hemerythrin HHE cation binding region  30.1 
 
 
177 aa  61.6  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.768096  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0685  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  27.34 
 
 
187 aa  55.5  0.0000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.434426  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  29.17 
 
 
185 aa  50.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1509  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.9 
 
 
187 aa  50.1  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0220946  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  27.94 
 
 
196 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12027  hypothetical protein  27.54 
 
 
255 aa  45.4  0.0004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000558386  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0065  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.55 
 
 
182 aa  44.3  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.73098  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2399  hypothetical protein  28.24 
 
 
224 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0283392  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2495  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24.83 
 
 
184 aa  43.5  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3025  hypothetical protein  29.85 
 
 
223 aa  42.7  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1353  hypothetical protein  32 
 
 
180 aa  42.4  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.086878 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0776  hypothetical protein  27.86 
 
 
270 aa  42.4  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000379179  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0244  hypothetical protein  29.25 
 
 
157 aa  42.4  0.004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0221  hypothetical protein  29.25 
 
 
157 aa  42.4  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0752  hypothetical protein  28.57 
 
 
270 aa  41.6  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00690211  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3164  hypothetical protein  26.9 
 
 
240 aa  40.8  0.01  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2511  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.9 
 
 
240 aa  40.8  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>