40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1086 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1086  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  100 
 
 		 180 aa  369  1e-101  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00113012  normal  0.0726864 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1277  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  60.34 
 
 		 185 aa  219  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000400802  normal  0.0499569 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1182  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  61.14 
 
 		 181 aa  215  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0279735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1071  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  57.54 
 
 		 183 aa  210  7.999999999999999e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0910  hypothetical protein  57.54 
 
 		 179 aa  204  7e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.162836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  55 
 
 		 181 aa  194  4.0000000000000005e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  53.33 
 
 		 180 aa  188  2.9999999999999997e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1046  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  50.28 
 
 		 178 aa  183  1.0000000000000001e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.012593  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1041  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  49.72 
 
 		 178 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00219982  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1142  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  49.72 
 
 		 178 aa  181  5.0000000000000004e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.325116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3249  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  49.72 
 
 		 178 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.890516  hitchhiker  0.00150235 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1108  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  49.72 
 
 		 178 aa  181  6e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.210963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2970  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  49.16 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000182912  normal  0.370735 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3052  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  49.16 
 
 		 178 aa  179  2e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0120617  normal  0.148457 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3150  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  48.6 
 
 		 178 aa  178  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.024365  normal  0.772285 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  49.14 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.13 
 
 		 179 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2550  putative hemerythrin  30.86 
 
 		 176 aa  93.2  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004449  hypothetical protein  28.42 
 
 		 183 aa  91.3  7e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0387473  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1937  hypothetical protein  26.14 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000015412  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00946  hypothetical protein  25.14 
 
 		 183 aa  79.7  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  28.83 
 
 		 197 aa  77.8  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1756  hemerythrin HHE cation binding region  25.42 
 
 		 177 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.88 
 
 		 196 aa  76.6  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  27.61 
 
 		 196 aa  75.5  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7704  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.41 
 
 		 186 aa  75.5  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1328  hypothetical protein  33.58 
 
 		 183 aa  75.1  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.242425  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  26.47 
 
 		 197 aa  73.2  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1774  hemerythrin HHE cation binding region  32.17 
 
 		 186 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  24.2 
 
 		 193 aa  67.8  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  26.06 
 
 		 194 aa  57  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  23.53 
 
 		 196 aa  53.9  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  25.79 
 
 		 199 aa  51.2  0.000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.17 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  24.24 
 
 		 437 aa  48.1  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0359  hypothetical protein  25.83 
 
 		 191 aa  48.1  0.00006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  26.9 
 
 		 189 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0570  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.68 
 
 		 154 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.645913 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0536  hypothetical protein  25 
 
 		 156 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  27.15 
 
 		 176 aa  42.4  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>