54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B3843 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B3843  hypothetical protein  100 
 
 		 343 aa  686    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7174  hypothetical protein  37.16 
 
 		 307 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  33.89 
 
 		 190 aa  97.8  2e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6235  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  38.15 
 
 		 194 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.840009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.33 
 
 		 191 aa  89.7  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  34.81 
 
 		 191 aa  85.9  9e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2455  hemerythrin HHE cation binding region  31.61 
 
 		 196 aa  84.7  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.22 
 
 		 195 aa  84.7  0.000000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1584  hypothetical protein  31.73 
 
 		 313 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.127319  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1603  hypothetical protein  33.55 
 
 		 313 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.193621 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7075  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  35.06 
 
 		 191 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.729723 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.41 
 
 		 199 aa  78.6  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  30.34 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0910  hemerythrin HHE cation binding region  31.29 
 
 		 194 aa  75.1  0.000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.17752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  32.93 
 
 		 198 aa  75.1  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0293  hemerythrin HHE cation binding protein  34.88 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  30.49 
 
 		 193 aa  73.6  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.75 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2331  hypothetical protein  43.88 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3098  hypothetical protein  43.88 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.677062  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1349  hypothetical protein  43.88 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1064  hypothetical protein  43.88 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1437  hypothetical protein  43.88 
 
 		 353 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2767  hemerythrin HHE cation binding region  28.85 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0539302  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1515  hemerythrin HHE cation binding region  29.06 
 
 		 176 aa  57.8  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3819  hemerythrin HHE cation binding region  24 
 
 		 196 aa  50.8  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1369  UspA domain-containing protein  27.87 
 
 		 144 aa  49.3  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.981582 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3872  hemerythrin HHE cation binding region  23.33 
 
 		 197 aa  48.5  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1855  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  24 
 
 		 196 aa  48.9  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.013511  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4024  hypothetical protein  29.03 
 
 		 193 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.336316 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0267  universal stress protein  27.66 
 
 		 145 aa  48.1  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.793437  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0803  UspA domain protein  27.21 
 
 		 212 aa  48.5  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2903  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.45 
 
 		 180 aa  47.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.75349  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  24.85 
 
 		 437 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1997  universal stress protein  28.69 
 
 		 144 aa  46.6  0.0006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0827286  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3549  hypothetical protein  26.35 
 
 		 178 aa  46.6  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5358  universal stress protein  28.69 
 
 		 144 aa  46.6  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.974267  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1479  hemerythrin HHE cation binding region  22.67 
 
 		 197 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.786202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3063  hypothetical protein  35.42 
 
 		 297 aa  45.8  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2737  hemerythrin HHE cation binding region  24.59 
 
 		 181 aa  45.8  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000357239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1676  hypothetical protein  27.42 
 
 		 143 aa  45.4  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1284  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  22.76 
 
 		 179 aa  46.2  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0263304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1362  universal stress family protein  27.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2525  universal stress family protein  27.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.245766  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2471  universal stress family protein  27.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3223  universal stress protein  27.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2614  universal stress protein family protein  27.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.586253  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2089  universal stress protein  27.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000150804  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1587  universal stress protein  27.87 
 
 		 144 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.240234  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  25.4 
 
 		 156 aa  44.3  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1228  UspA domain-containing protein  27.87 
 
 		 144 aa  43.9  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.156365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1284  UspA domain protein  28.33 
 
 		 147 aa  43.9  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4983  hypothetical protein  31.97 
 
 		 145 aa  42.7  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  24.19 
 
 		 150 aa  42.7  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>