33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_6523 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  100 
 
 		 218 aa  436  1e-121  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  35.19 
 
 		 222 aa  141  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  36.67 
 
 		 212 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4061  hypothetical protein  35.78 
 
 		 232 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0644782  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0955  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.33 
 
 		 236 aa  97.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1115  hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.05 
 
 		 241 aa  97.4  1e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1048  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31 
 
 		 241 aa  89  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.94 
 
 		 747 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5843  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.27 
 
 		 213 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.737154  normal  0.680441 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2034  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  30.67 
 
 		 216 aa  65.9  0.0000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.568645 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0219  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  33.1 
 
 		 191 aa  65.9  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00618287 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3557  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  25.87 
 
 		 219 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5446  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  26.92 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1243  hypothetical protein  28.57 
 
 		 262 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407567  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2830  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.28 
 
 		 194 aa  62  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.168396  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0785  hypothetical protein  32.35 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1209  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.99 
 
 		 195 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5355  hypothetical protein  32.41 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  31.11 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1354  rhodopsin-like G-protein  32.35 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3814  hypothetical protein  26.34 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.755725  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0227  hemerythrin HHE cation binding protein  29.46 
 
 		 193 aa  49.3  0.00004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.172932  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  29 
 
 		 437 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5608  hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.9 
 
 		 190 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.272772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  32.35 
 
 		 274 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1156  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.88 
 
 		 157 aa  43.5  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.902168 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1931  hypothetical protein  26.17 
 
 		 407 aa  44.3  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000706509  hitchhiker  0.00330228 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2548  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.1 
 
 		 190 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.21 
 
 		 306 aa  42.4  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0042  hemerythrin HHE cation binding region  30 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1521  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.21 
 
 		 199 aa  42  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.343981  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28 
 
 		 191 aa  41.6  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  32.35 
 
 		 311 aa  41.6  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>