31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0736 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_0736  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  421  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.388253  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4552  cyclase/dehydrase  31.93 
 
 
432 aa  77.4  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0499  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.88 
 
 
222 aa  67.8  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.61 
 
 
747 aa  63.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.105486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5843  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.67 
 
 
213 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.737154  normal  0.680441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3557  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.85 
 
 
219 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7884  hypothetical protein  29.3 
 
 
212 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.765433  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2034  hemerythrin hhE cation binding domain-containing protein  31.43 
 
 
216 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.568645 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1243  hypothetical protein  30.07 
 
 
262 aa  59.7  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.407567  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0785  hypothetical protein  29.09 
 
 
243 aa  57.8  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6523  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.11 
 
 
218 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0957507  normal  0.103756 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0955  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.73 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3897  hemerythrin HHE cation binding region  30 
 
 
351 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.65028  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2125  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.18 
 
 
284 aa  48.9  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0724883  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3458  metallophosphoesterase  33.96 
 
 
285 aa  47.4  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  26.03 
 
 
543 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0364  ABC transporter  24.06 
 
 
437 aa  45.1  0.0007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0199162  unclonable  0.000000063148 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0077  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.31 
 
 
158 aa  45.1  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.556159 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5446  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.52 
 
 
215 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.13322 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7183  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  28.57 
 
 
190 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0069  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.3 
 
 
158 aa  44.3  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4061  hypothetical protein  26.57 
 
 
232 aa  45.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0644782  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0307  hypothetical protein  25.16 
 
 
184 aa  44.3  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000126228  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  30.14 
 
 
531 aa  44.3  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3084  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  26.85 
 
 
191 aa  43.5  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.664175  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  31.34 
 
 
306 aa  43.5  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2197  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  27.27 
 
 
205 aa  43.5  0.003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  25.17 
 
 
557 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3669  hypothetical protein  25.93 
 
 
185 aa  42.4  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0292536 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5355  hypothetical protein  29.9 
 
 
145 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4679  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  30.11 
 
 
235 aa  42.4  0.006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>