18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_3262 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_3262  hypothetical protein  100 
 
 		 155 aa  309  1e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.704224  normal  0.649744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3347  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  47.24 
 
 		 164 aa  140  6e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.329659  hitchhiker  0.00378546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0252  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  49.03 
 
 		 160 aa  140  7e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1375  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  40.69 
 
 		 168 aa  84.7  4e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2460  putative F420-dependent oxidoreductase  40.4 
 
 		 531 aa  73.9  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.952845  normal  0.0130004 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1237  hypothetical protein  33.1 
 
 		 157 aa  71.6  0.000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  37.5 
 
 		 306 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  36.36 
 
 		 274 aa  67.4  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2483  luciferase-like monooxygenase  33.33 
 
 		 543 aa  66.2  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37849 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5355  hypothetical protein  32.35 
 
 		 145 aa  65.5  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.161849  normal  0.474804 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1156  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  31.43 
 
 		 157 aa  63.9  0.0000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.902168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3031  coenzyme F420-dependent N5 N10-methylene tetrahydromethanopterin reductase and related flavin-dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 557 aa  63.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1636  Luciferase-like monooxygenase  35.19 
 
 		 519 aa  62.4  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.0262189 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30060  flavin-dependent oxidoreductase, F420-dependent methylene-tetrahydromethanopterin reductase  36.46 
 
 		 507 aa  60.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.15798  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2125  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  28.47 
 
 		 284 aa  60.5  0.000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0724883  normal  0.145093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  33.68 
 
 		 311 aa  59.7  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1115  hemerythrin HHE cation binding domain protein  29.2 
 
 		 241 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2094  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  30.59 
 
 		 747 aa  40.8  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.105486 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>