116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4541 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_4541  hypothetical protein  100 
 
 
177 aa  353  6.999999999999999e-97  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.19385  normal  0.304332 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5424  hypothetical protein  55.88 
 
 
311 aa  154  6e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.741222  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3761  Hemerythrin HHE cation binding domain protein  58.33 
 
 
274 aa  145  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.80349  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2183  hemerythrin HHE cation binding domain-containing protein  51.85 
 
 
306 aa  143  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.576413  normal  0.216575 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1007  hypothetical protein  51.47 
 
 
140 aa  136  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.2875 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2315  hypothetical protein  49.66 
 
 
142 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.121739  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2362  hypothetical protein  49.66 
 
 
142 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.579861  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2354  hypothetical protein  48.97 
 
 
142 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3783  hypothetical protein  47.52 
 
 
150 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2616  hypothetical protein  47.14 
 
 
149 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4642  hypothetical protein  47.52 
 
 
135 aa  129  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.543378  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4211  hypothetical protein  47.52 
 
 
135 aa  126  1.0000000000000001e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0885  hypothetical protein  44.03 
 
 
151 aa  124  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1187  hypothetical protein  47.14 
 
 
146 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6160  hypothetical protein  45.45 
 
 
144 aa  114  1.0000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.237259  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2212  hypothetical protein  45.03 
 
 
144 aa  110  7.000000000000001e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0956  hypothetical protein  47.1 
 
 
161 aa  110  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.2542  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0482  hypothetical protein  42.86 
 
 
164 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1416  hypothetical protein  46.27 
 
 
149 aa  107  1e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.61227  normal  0.064122 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2630  hypothetical protein  47.79 
 
 
153 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.421408  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2675  hypothetical protein  47.79 
 
 
153 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.313846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2659  hypothetical protein  47.79 
 
 
153 aa  107  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.463167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7866  hypothetical protein  44.12 
 
 
145 aa  103  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4680  hypothetical protein  39.34 
 
 
150 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4766  hypothetical protein  39.34 
 
 
150 aa  96.3  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.203772  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13580  hypothetical protein  41.6 
 
 
151 aa  95.9  3e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0664685 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2511  hypothetical protein  39.23 
 
 
134 aa  95.5  3e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00847737  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5065  hypothetical protein  39.34 
 
 
150 aa  94.7  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.336664  normal  0.524632 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3084  hypothetical protein  35.66 
 
 
145 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3144  hypothetical protein  35.66 
 
 
145 aa  94.7  7e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.193303  normal  0.123554 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5388  hypothetical protein  42.97 
 
 
144 aa  94  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3104  hypothetical protein  35.66 
 
 
145 aa  93.6  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.412887  normal  0.643759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5096  hypothetical protein  35.2 
 
 
196 aa  93.2  2e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0570836  normal  0.0453765 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2023  hypothetical protein  34.97 
 
 
145 aa  92.4  3e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.406652 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2456  hypothetical protein  40.88 
 
 
140 aa  92  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.597915  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1559  pyridoxamine 5'-phosphate oxidase-related FMN-binding  42.31 
 
 
143 aa  91.7  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.336696  normal  0.577316 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2106  hypothetical protein  40 
 
 
177 aa  90.9  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.334754 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2798  hypothetical protein  35.66 
 
 
140 aa  90.1  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00699009  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3827  hypothetical protein  37.06 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1126  hypothetical protein  36.43 
 
 
147 aa  89  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.726493  normal  0.303948 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4989  hypothetical protein  33.57 
 
 
145 aa  89  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.794366  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2976  hypothetical protein  43.18 
 
 
163 aa  89  3e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000649339  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5840  hypothetical protein  33.33 
 
 
143 aa  88.2  6e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.765788  normal  0.503571 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1090  hypothetical protein  38.62 
 
 
145 aa  86.3  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11590  hypothetical protein  32.87 
 
 
148 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  1.30585e-85  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0623  hypothetical protein  40.16 
 
 
144 aa  86.3  2e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0266  hypothetical protein  37.21 
 
 
133 aa  86.3  2e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0985  hypothetical protein  34.27 
 
 
145 aa  85.9  3e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0468293  normal  0.0249112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10710  conserved hypothetical protein TIGR00026  36.36 
 
 
360 aa  85.1  5e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.735464 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0997  hypothetical protein  34.27 
 
 
140 aa  84.3  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0978  hypothetical protein  45.13 
 
 
145 aa  84  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00155149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11000  conserved hypothetical protein TIGR00026  36.22 
 
 
138 aa  82.8  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4262  hypothetical protein  37.86 
 
 
146 aa  82.8  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.877042  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0749  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441888  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0763  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.127408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0743  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  80.9  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.163997  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2015  hypothetical protein  43.7 
 
 
168 aa  80.1  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.364404  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0052  hypothetical protein  35.61 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0902572  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0061  hypothetical protein  35.61 
 
 
159 aa  79.7  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0484096 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1788  hypothetical protein  41.12 
 
 
161 aa  79.3  0.00000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.370056 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11287  hypothetical protein  37.12 
 
 
149 aa  78.6  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.91215  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2498  hypothetical protein  35.07 
 
 
157 aa  78.2  0.00000000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3972  hypothetical protein  34.33 
 
 
169 aa  78.2  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.604025  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0042  hypothetical protein  34.09 
 
 
159 aa  77.8  0.00000000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.274125  normal  0.0949718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1505  hypothetical protein  31.54 
 
 
166 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0257  hypothetical protein  30.34 
 
 
147 aa  75.5  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5261  hypothetical protein  36.54 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3969  hypothetical protein  36.15 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.827845  normal  0.0645114 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3955  hypothetical protein  36.15 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4029  hypothetical protein  36.15 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.412865  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2085  hypothetical protein  39.85 
 
 
164 aa  75.1  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.776425  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5872  hypothetical protein  36.36 
 
 
144 aa  75.1  0.0000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0817748 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4153  hypothetical protein  39.71 
 
 
152 aa  74.7  0.0000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0512  hypothetical protein  35.96 
 
 
157 aa  72.4  0.000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0833  hypothetical protein  37.69 
 
 
143 aa  72.8  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1829  hypothetical protein  34.56 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0349871  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1876  hypothetical protein  34.56 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0838475  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1810  hypothetical protein  34.56 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0179461  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4640  hypothetical protein  31.3 
 
 
143 aa  70.5  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6204  hypothetical protein  40.74 
 
 
164 aa  69.7  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4634  Transcriptional regulators-like protein  30.07 
 
 
324 aa  69.3  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.969868 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1838  hypothetical protein  37.38 
 
 
162 aa  66.2  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1480  hypothetical protein  33.6 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1332  hypothetical protein  39.36 
 
 
158 aa  65.9  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.223024  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4457  hypothetical protein  33.33 
 
 
152 aa  65.5  0.0000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1728  hypothetical protein  38.35 
 
 
138 aa  65.5  0.0000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247315  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2718  hypothetical protein  33.87 
 
 
157 aa  65.1  0.0000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4618  hypothetical protein  36.43 
 
 
164 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.168908  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2238  hypothetical protein  34.09 
 
 
152 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.477242  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5225  hypothetical protein  32.76 
 
 
154 aa  64.3  0.0000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.653712 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2620  hypothetical protein  30.34 
 
 
148 aa  63.2  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00012961  normal  0.0164615 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0254  hypothetical protein  34.75 
 
 
157 aa  63.2  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2031  hypothetical protein  36.72 
 
 
125 aa  62.8  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0287759  normal  0.679852 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13199  hypothetical protein  34.23 
 
 
119 aa  61.6  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.190211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1321  hypothetical protein  38.3 
 
 
174 aa  61.6  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.641608  normal  0.0856253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1364  hypothetical protein  39.6 
 
 
159 aa  61.2  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.951673  normal  0.623642 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2352  hypothetical protein  37.21 
 
 
150 aa  60.1  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.146044  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1126  hypothetical protein  32.43 
 
 
146 aa  60.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.331179  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1328  hypothetical protein  27.33 
 
 
153 aa  59.7  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0372  hypothetical protein  40 
 
 
150 aa  60.1  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>